生信期刊举荐#17：Cancer Research

试可验证。其中都，ELK3、MXD1和MYB在Abi敏感性细胞核和Abi乙型肝炎细胞核的存活中都体现七区别关键作用。此外，ELK3调节细胞核搬迁能力，这有可能对mCRPC有都对。总的来说，这些发现推断出了驱动Abi反应会的潜在RNA机制，表明TraRe是一个有前所途的工具，可以基于已确定的RNA互联中都断产生原先假设。

02

Comprehensive Evaluation of Machine Learning Models and Gene Expression Signatures for Prostate Cancer Prognosis Using Large Population Cohorts

机器学习假设和基因强调基本特征对前所列腺癌HRS的综合口碑

刊载订于：03 May 2022

能用来自公共原始数据库的1558名高血压前所列腺癌患者的10个RNA组学原始数据集，对15种机器学习(ML)线性和30种已刊载的基于前所列腺癌基因强调的HRS基本特征进行管理系统评估。最近，生存分析假设在风险评估方面优于二元归纳假设，Cox假设与岭正则化(Cox-Ridge)和Cox假设的偏最小二乘(PLS)重返(Cox-PLS)-的精度举例来说比其他方法来得稳健。基于Cox-Ridge线性，几个顶级预测签名辨识出与商用假设相当甚至来得好的精度。这些发现将有助于鉴别现有的HRS基本特征，这些基本特征有望在前所瞻性集中研究中都进一步可验证，促进HRS假设发展。此外，本集中研究共享了来自大型高血压前所列腺癌队列的珍贵原始数据资源，可用于整合、可验证和评估原先统计方法和水分子基本特征，以改善前所列腺癌的管理。

03

Spatially Resolved Single-Cell Assessment of Pancreatic Cancer Expression Subtypes Reveals Co-expressor Phenotypes and Extensive Intratumoral Heterogeneity

肠胃腺癌强调亚型的空间分辨单细胞核评估推断出了共强调特异性和较广的内一般而言

刊载订于：03 February 2023

通过大比率RNA测比率，肠胃导管腺癌(PDAC)已被分为独创亚型和基底样RNA亚型，但是RNA亚型的复杂性比最初引介的大。为了集中了解PDAC亚型，整合了多重免疫细胞荧光(mIF)泥浆，比率化6种PDAC亚型标上(CLDN18.2、TFF1、GATA6、KRT17、KRT5和S100A2)的蛋白强调，并强制对切掉标本和核心穿刺组织学的肠胃腺进行空间分辨、单细胞核安全检查。高血压和白血病均表现出显著的内亚型一般而言，这种一般而言与患者HRS关的，实际上于个体表皮的尺度上，并在患者来源的类肝脏培养中都显著降低。同时强调独创和框架标上的细胞核实际上于90%的中都，实际上于框架-独创极化月份体上，并且在带有来得多框架和独创细胞核群人混合物的中都富集。表皮内的细胞核-细胞核邻近最近，共强调细胞核有可能代表强调亚型两极间的中都间状态。mIF泥浆确定的较广的内一般而言有可能为PDAC患者的HRS和治疗选择共享反馈。

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